Vítejte na stránkách ÚMBR
Ústavu molekulární biologie a radiobiologie!

Ústav molekulární biologie a radiobiologie se zaměřuje zejména na studium molekulární podstaty interakce mezi rostlinou a okolním prostředím. Zkoumáme interakce s abiotickými i biotickými faktory a využíváme široké škály „omických" přístupů. Dlouhodobě v těchto oblastech dosahujeme národní i mezinárodní excelence.

Naše pracoviště má dva hlavní výzkumné směry:

• Interakce signálních drah teploty, světla a rostlinných hormonů
  prof. Brzobohatý, doc. Novák
• Molekulární podstata interakcí mezi rostlinou a mikroorganismy
  doc. Černý

Všechny směry jsou úzce propojené a vycházejí z obdobných metodických základů, kterým dominují techniky založené na hmotnostní spektrometrii s následnou bioinformatickou analýzou. Hmotnostní spektrometrii používáme pro sledování hladiny proteinů, jejich modifikací a interakcí, profilování metabolomu, analýzu lipidů a cílené sledování sekundárních metabolitů.

Metabolomika

Thermo Q Exactive GC Orbitrap GC-MS/MS, Thermo, doplněno o vybavení pro analýzu volatilních látek

Proteomika a Lipidomika

Vybavení pro LC-MS omické analýzy: Orbitrap Fusion Lumos and Evosep ENO, Thermo Dionex Ultimate 3000 RSLC nano, UHR maXis impact q-TOF mass spectrometer, TSQ Quantiva triple quadrupole mass spectrometer

Kultivace a Měření

Kultivační komory doplněné diodovými zdroji monochromatického světla (R, FR, B). Skleníky s širokým rozmezím regulace světelných režimů. Fluorescenční kamera FlourCam Handy FC 1000-H pro měření fotosyntetických parametrů.

Transkriptomika

Robotizace a kompletní vybavení pro transkriptomickou analýzu

Bioinformatika

Zpracování komplexních dat z omických analýz a fenotypování