Ing. Miroslav Berka, Ph.D.
Odborný asistent
Kancelář: BA03P1076b (C01.76b) | Tel: +420 545 133 374
✉ miroslav.berka [at] mendelu.cz
Vliv salicylátů na růst a fyziologii druhů rodu Phytophthora
Co bude náplní práce?
- Kultivace vybraných druhů rodu Phytophthora a testování účinku salicylátů
- Hodnocení změn růstu, morfologie a fyziologické stresové odpovědi
- Analýza vybraných metabolitů a volatilních látek vznikajících v reakci na ošetření
Co si můžeš vyzkoušet?
- Sterilní práci a základní mikrobiologické techniky
- Přípravu roztoků, médií a experimentálních koncentrací
- Práci s mikroskopem a dokumentaci vzorků
- Přípravu vzorků pro instrumentální analýzy
- Základy práce s GC–MS daty a jejich interpretaci
Funkce transkripčních faktorů CRF v interakcích rostlin s mikroorganismy
Co bude náplní práce?
- Kultivace kontrolních a CRF mutantních linií Arabidopsis thaliana
- Inokulace rostlin vybranými prospěšnými nebo patogenními mikroorganismy
- Hodnocení růstu, fyziologických změn a odpovědi jednotlivých genotypů
- Analýza proteinů, metabolitů a kořenových exudátů
Co si můžeš vyzkoušet?
- Kultivaci mikroorganismů a práci s mutantními liniemi A. thaliana
- Odběr a zpracování kořenových exudátů
- Extrakci metabolitů a proteinů z rostlinných pletiv
- Přípravu vzorků pro metabolomické a proteomické analýzy
- Propojování metabolických, proteinových a fenotypových změn
Multiomická analýza vývoje plodů jahod
Co bude náplní práce?
- Omické analýzy vývojových stádií plodů jahod
- Monitorování změn primárních a sekundárních metabolitů a proteinů
- Analýza vonných látek a snímání pomocí hyperspektrální kamery
Co si můžeš vyzkoušet?
- Extrakci metabolitů, extrakci a purifikaci proteinů
- Přípravu vzorků pro hmotnostní spektrometrii
- Metody analýzy volatilních látek a spektrofotometrie
- Práci se špičkovými přístroji (LC-MS a GC-MS) a hyperspektrální kamerou
Volatilní metabolity mikroorganismů jako indikátory biologické aktivity půdy
Co bude náplní práce?
- Charakterizace volatilních organických látek (VOCs) produkujících půdními mikroorganismy
- Korelace složení volatilních látek se stavem a úrodností půdního prostředí
- Měření a sledování změn v závislosti na typu půdy a managementu
Co si můžeš vyzkoušet?
- Odběr a přípravu půdních vzorků
- Techniky odběru plynných vzorků (HS-SPME)
- Instrumentální analýzu na GC-MS
- Vyhodnocení komplexních spektrometrických dat
Zemedelska 1, 613 00, Brno
E-mail:
Head of Department:
