Ing. Miroslav Berka, Ph.D.

Odborný asistent

Kancelář: BA03P1076b (C01.76b) | Tel: +420 545 133 374

✉ miroslav.berka [at] mendelu.cz

 

Bakalářská

Vliv salicylátů na růst a fyziologii druhů rodu Phytophthora

Co bude náplní práce?

  • Kultivace vybraných druhů rodu Phytophthora a testování účinku salicylátů
  • Hodnocení změn růstu, morfologie a fyziologické stresové odpovědi
  • Analýza vybraných metabolitů a volatilních látek vznikajících v reakci na ošetření

Co si můžeš vyzkoušet?

  • Sterilní práci a základní mikrobiologické techniky
  • Přípravu roztoků, médií a experimentálních koncentrací
  • Práci s mikroskopem a dokumentaci vzorků
  • Přípravu vzorků pro instrumentální analýzy
  • Základy práce s GC–MS daty a jejich interpretaci
Bakalářská

Funkce transkripčních faktorů CRF v interakcích rostlin s mikroorganismy

Co bude náplní práce?

  • Kultivace kontrolních a CRF mutantních linií Arabidopsis thaliana
  • Inokulace rostlin vybranými prospěšnými nebo patogenními mikroorganismy
  • Hodnocení růstu, fyziologických změn a odpovědi jednotlivých genotypů
  • Analýza proteinů, metabolitů a kořenových exudátů

Co si můžeš vyzkoušet?

  • Kultivaci mikroorganismů a práci s mutantními liniemi A. thaliana
  • Odběr a zpracování kořenových exudátů
  • Extrakci metabolitů a proteinů z rostlinných pletiv
  • Přípravu vzorků pro metabolomické a proteomické analýzy
  • Propojování metabolických, proteinových a fenotypových změn
Bakalářská

Multiomická analýza vývoje plodů jahod

Co bude náplní práce?

  • Omické analýzy vývojových stádií plodů jahod
  • Monitorování změn primárních a sekundárních metabolitů a proteinů
  • Analýza vonných látek a snímání pomocí hyperspektrální kamery

Co si můžeš vyzkoušet?

  • Extrakci metabolitů, extrakci a purifikaci proteinů
  • Přípravu vzorků pro hmotnostní spektrometrii
  • Metody analýzy volatilních látek a spektrofotometrie
  • Práci se špičkovými přístroji (LC-MS a GC-MS) a hyperspektrální kamerou
Bakalářská

Volatilní metabolity mikroorganismů jako indikátory biologické aktivity půdy

Co bude náplní práce?

  • Charakterizace volatilních organických látek (VOCs) produkujících půdními mikroorganismy
  • Korelace složení volatilních látek se stavem a úrodností půdního prostředí
  • Měření a sledování změn v závislosti na typu půdy a managementu

Co si můžeš vyzkoušet?

  • Odběr a přípravu půdních vzorků
  • Techniky odběru plynných vzorků (HS-SPME)
  • Instrumentální analýzu na GC-MS
  • Vyhodnocení komplexních spektrometrických dat



Zemedelska 1, 613 00, Brno


E-mail:

umbr [at] mendelu.cz

Head of Department:

doc. Mgr. Martin Černý, Ph.D.