doc. Mgr. Martin Černý, Ph.D.
Vedoucí pracoviště
Kancelář: BA03P1076b (C01.76b) | Tel: +420 545 133 374
✉ martincerny83 [at] gmail.com
Bakalářská Ing. Tereza Matysková | konzultantka
Interakce mezi druhy vodních makrofyt (Lemnaceae) v polykultuře
Souboj o vodní hladinu: koexistence a kompetice nejmenších kvetoucích rostlin světa
Co bude náplní práce?
- Hodnocení růstových parametrů (RGR) a pokryvnosti hladiny v monokulturách vs. polykultuře
- Sledování kompetice a růstových strategií vybraných zástupců (Wolffia, Spirodela, Lemna)
- Měření parametrů fotosyntézy a fyziologické odpovědi
- Identifikace a kvantifikace volatilních látek zprostředkovávajících alelopatii
- Sledování vegetativního množení a tvorby turionů (klidových stádií)
Co si můžeš vyzkoušet?
- Design a realizaci experimentů substituční řady s vodními makrofyty
- Analýzu fluorescenčních obrazů chlorofylu na zařízeních FluorCam
- Odběr plynných vzorků a analýzu těkavých látek na GC-MS
- Kultivaci mikroskopických i větších druhů okřehků v kontrolovaných podmínkách
- Vyhodnocení dat kompetičních vztahů, fyziologie a chemické komunikace
Bakalářská
Malé biomolekuly obsahující síru a jejich role v regulaci růstu
Nová třída fytohormonů?
Co bude náplní práce?
- Studium účinků sírových látek (H₂S, CH₃SH, C₂H₆S, C₂H₆S₂, C₂H₆S₃, methionin, cysteamin) na růst rostlin
- Hodnocení vlivu těchto molekul na odolnost vůči stresu a interakce s mikroby
- Molekulární analýza působení látek a jejich zapojení do signálních drah
- Ověřování hypotéz o potenciální roli těchto molekul jako nové třídy fytohormonů
Co si můžeš vyzkoušet?
- Testování fyziologických účinků volatilních sloučenin na rostliny
- Molekulárně-biologické a biochemické analýzy signálních drah
- Monitorování interakcí rostlin s mikroorganismy
- Vyhodnocování hormonálních a metabolických odpovědí
Bakalářská / Metodická
Možnosti využití automatizovaného systému LC-MS pro analýzu malých molekul
Evosep ENO: nový standard omiky a hormonálních analýz
Co bude náplní práce?
- Vývoj a optimalizace metodiky s využitím C18 špiček pro metabolomiku
- Příprava vzorků pro rychlé a vysoce reprodukovatelné hormonální analýzy rostlin
- Testování a validace analytického systému LC-MS Evosep ENO
- Srovnání účinnosti a citlivosti nové metodiky se standardními postupy
Co si můžeš vyzkoušet?
- Práci se špičkovou LC-MS technologií (Evosep ENO)
- Přípravu a mikroextrakci vzorků na C18 špičkách
- Cílenou i necílenou analýzu rostlinných hormonů a metabolitů
- Metodický vývoj a optimalizaci MS parametrů
Bakalářská / Diplomová
Otisk biomolekul v čase: letokruhy a jejich složení
Odhalování stopy klimatických změn v biochemickém složení dřeva
Co bude náplní práce?
- Analýza biochemického složení letokruhů pomocí omických přístupů (proteomika, metabolomika, lipidomika)
- Extrakce a kvantifikace proteinů a metabolitů ze suchého dřeva
- Modelování vztahů mezi biochemickými profily a historickými klimatickými výkyvy
- Identifikace biomolekulárních markerů pro čtení historie prostředí
Co si můžeš vyzkoušet?
- Sofistikované metody extrakce biomolekul z obtížných rostlinných pletiv
- Instrumentální analýzy na GC-MS a LC-MS
- Práci s proteomickými a metabolomickými daty
- Propojování biochemických dat s dendrochronologií a klimatickými daty
Bakalářská / Diplomová
Projekt PeaBreed: Identifikace molekulárních znaků odolnosti hrachu vůči infekci Fusarium
Omické přístupy k posílení odolnosti klíčové evropské bílkovinné plodiny
Co bude náplní práce?
- Charakterizace biochemické odpovědi hrachu setého (Pisum sativum) na infekci rodem Fusarium
- Aplikace proteomických a metabolomických přístupů pro identifikaci molekulárních markerů rezistence
- Sledování změn v proteinovém a metabolickém profilu u kontrastních genotypů hrachu
- Propojování omických dat s cílem vývoje odolnějších odrůd pro udržitelnou bioekonomiku
Co si můžeš vyzkoušet?
- Extrakci a purifikaci proteinů a metabolitů z kořenových pletiv
- Moderní hmotnostně-spektrometrické analýzy (LC-MS / Proteomika & Metabolomika)
- Bioinformatické zpracování omických dat a vyhledávání biomarkerů
Zemedelska 1, 613 00, Brno
E-mail:
Head of Department: